Esta pergunta já tem o seu tempo, portanto respondo para aqueles que possam ter o mesmo problema.... Caso não aparecer a prespetiva de Java EE usando as indicações:
Confirmem se descarregaram o eclipse correcto. (As versões, "luna, kepler, neon etc..") é indiferente (Todos tem a opção de adicionar Java EE)
No momento de fazer o download, escolham "Packages" no site do eclipse para assim seleccionar o IDE orientado ao que querem programar e escolham Eclipse for Java EE Developers.
Cumprimentos
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