Bom dia,
Se usares MySQL tens algumas vantagens mais tarde em tornar a BD acessível para web, pelo facto do MySQL se comportar melhor em ambientes web do que o SQL-Server. No SQL-Server tens um limite de tamanho na versão express de 10GB por Base de dados. Ainda não sei se a versão para GNU/Linux terá essa mesma limitação, na edição Express, mas de qualquer das formas portar uma BD de MS-SQLServer para MySQL também não é nada do outro mundo e existem muito boas ferramentas gratuitas que fazem essa tarefa com meia dúzia de clics, acabando com essa limitação e podes na mesma usar todos os "assistentes" do VS para te facilitar a vida, enquanto não estás habituado a fazer as coisas "à la pata"!
Outra vantagem, partindo do pressuposto que estás a fazer tudo em Windows, será a possibilidade de usares os MSOfficeInterop, para integrares por exemplo o Excell na tua app.
Quanto a web, eu apesar de gostar de python e não gostar assim tanto de PHP, também existem coisas no python que desgosto, por exemplo da indentação ser parte da sintax. Mas opiniões são opiniões, e apesar de ainda programar PHP, não sou propriamente fã de php, coisa que pode mudar com o PHP7. Vamos a ver.
Neste momento se calhar seria mesmo bom começares a perceber como funcionam as coisas, experimentares algo pequeno, tipo um form simples em C#, para mostrar uma datagridview com dados vindos de uma BD, por exemplo.
O que já tens em excell, mais concretamente os dados, com um pouco de jeito podem ser transportados para uma nova base de dados.
Cordiais cumprimentos,
Apocsantos
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